Di Jepang ada sebuah sekolah bernama SMP Teikou yang memiliki pemain tangguh dan berbakat diatas rata-rata yang selalu memenangkan permainan dengan mudah, pemain inti dari sekolah tersebut sering disebut dengan julukan “Kiseki No Sedai”. Kini setelah lulus SMP masing-masing dari mereka mendaftar di tiap SMA yang berbeda dimana SMA tersebut memiliki prestasi dalam Basket. Namun, ada 1 lagi pemain berbakat diantara Kiseki no Sedai, ia adalah Tetsuya Kuroko, sang bayangan ke-enam. Kuroko kini masuk ke sekolah Seirin, walaupun terlihat biasa saja, namun kuroko juga salah satu dari pemain generasi ajaib. Bersamaan dengan masuknya seorang lagi siswa pindahan dari Amerika bernama Kagami Taiga ke Seirin, kini Kuroko menemukan cahaya barunya dan bertujuan mengalahkan anggota dari generasi keajaiban / Kiseki no Sedai lainnya.